微生物取样新方法大全

随着数据采集技术的发展，我们对生常为的认识逐步深入，生常为在临床以及科研上的应将用愈加多，而生常为起名样的正确与否并不需要并不需要因素生常为数据的确切性。

因此，生常为的起名样分析方法就显得格外最主要。

首先，我们需要要在频域的处理过程中所，未收意以下几个方面：

(1) 所有研究成果所用到的频域用具必须是经过消毒的（如材料袋、频域器、采血管、试管、握杖、匙、刀类工具等）。

(2) 利用材料个人信息，频域在此之前或频域后应将在盛装材料的容器或材料袋上尽快贴上标签，每件材料必须标示明楚（例如品名、可能、数可用、频域区域内、频域人及频域时间表等）。

(3) 特地尽可用将样品成品 3-5 份硬碟；建议每组起名 6 个及以上减法较为合适，数 3 个减法。

(4) 用到谷禾频域管的研究成果所材料，可以室温运输；如果可不频域管，则必须汽化-80℃惟有有，惟有有之后切忌长时间冻融；汽化寄出时特地将材料徙于泡沫箱中所，用气球寄出。

然而材料种类繁多，相异的材料频域有相异的方案，下面详实介绍每类材料也就是说将的频域方案。

生存环境生常为

普通沙木

(1)去除表面可能会会浮木、凋落常为等，根据沙木可能会，选择是否过2mm筛网，每个材料从3个及以上起名样点捕获并混杂而成，建议将样品成品 3-5 份硬碟；

未收：起名样时需要未收意每个起名样点的起名木尺度及起名样可用应将微小一致，木样上层与下层的数可用要有所相异。

(2)惟有有于杀霉离心泵所，徙于泡沫箱（冰袋或气球）中所，0°C以下带回研究成果所室；

(3)如果可能会下不容许尽快提DNA，可将材料徙于-80°C冷藏中所惟有有，并通过气球寄出至日本公司后提频域品总 DNA。

根际沙木

根际，是指受寄生植常为根系活动因素，在常为理、矿常为学和生常为学连续性上相异于木体的那之外微域生存环境。之外研究成果是针对沙木生常为与寄生植常为中间的相互关系，因此需要要对根际木开展频域。

(1) 捕获植株，去除根周较分散的木，仍附着在根系表面可能会会的视为根际木。将寄生植常为徙于被装冰袋或气球的保温箱中所，避光可能会下，0℃以下带回研究成果所室；

(2)正要杀霉容器，将寄生植常为根系之外徙于缓冲液体（PBS或生理盐水后）中所震荡，震荡时间和高强度依据样品实际可能会调整，洗下根际木；

(3)将洗涤液体开展高速离心，利用沙木沉淀，若沉淀较少，也可去除膜，同一样方频域的样品开展多点等可用混杂；

(4) 将样品成品至离心泵所，密封，标示样品个人信息后液体氮速冻，徙于-80℃冷藏惟有有，气球寄出。

水后体沉积常为、底泥

捕获水后底沉积常为5~10 g（具体尺度依据研究成果所最后目标确定），惟有有于冻存泵所，标示好样品个人信息后液体氮速冻或徙于被装气球的泡沫盒中所，黑影生存环境下，决定带回研究成果所室，-80℃冷藏惟有有，气球寄出。

活性污泥

多点频域并等可用微小混杂至平均10 ml的悬浮污泥样品（5~10 g堆积常为），惟有有至冻存泵所，标示好样品个人信息后液体氮速冻或徙于被装气球的泡沫盒中所，黑影生存环境下，决定带回研究成果所室，-80℃冷藏惟有有，气球寄出。

水后体

(1) 捕获水后样应将未收意杀霉操作，防范杂霉掺入。

(2) 根据研究成果所设徙，选起名须要小孔的滤膜，适用水后体抽滤机抽滤 1~100 L 水后体（相异水后质间差异极大），或抽滤至滤膜上可见轻微覆盖常为。

对于乳白色水后体，建议去除在此之前静徙转化悬浮粉尘，先用大小孔滤膜去除一遍，之前用小小孔滤膜去除。

(3) 标示好样品个人信息后液体氮速冻或徙于被装气球的泡沫盒中所，黑影生存环境下，决定带回研究成果所室，-80℃冷藏惟有有，气球寄出。

未收：根据水后体中所生常为含可用相异，频域可用各不有所相异：污水后等霉群丰富的水后体用可用一般为200-1000 ml，湖、河流等自然水后体一般为 1-2 L，自来水公司后等霉群含可用高的水后体则一般为 1-5 L，海洋水后体随着地理位徙、时节和频域尺度固定较大。

蔬果

包装蔬果

必需要起名原包装，检验在此之前不用开封，防酸雨。

大块冷冻蔬果，应将从几个相异握部用消毒工具频域，使材料很强充份的民族特色；

在将材料寄出研究成果所室在此之前，要始终保持材料处于冷冻静止状态。材料一旦融化，不能之前冻，保持冷却即可。

液体蔬果

一般来说完全，液体态蔬果较容易得到民族特色材料。

盛摆在大容器所的液体态蔬果（如牛奶、奶昔、咖啡等），频域时可连续或不间断蒸；

盛摆在小容器的液体态蔬果，可在频域在此之前将液体上下颠倒，使其完全混匀。较大的材料要摆在已消毒的容器中所送进研究成果所室。研究成果所室在频域测定之后应将将液体之前完全混匀一次。

对于牛奶、葡萄酿、寄生植常为油等，常采用虹吸法（或用长形吸管）按相异尺度分层频域，并混匀。如材料粘稠或含有液体悬浮常为或不微小液体应将充份搅匀后，方可频域。

半液体蔬果

用杀霉操作启动时包装，此类材料无法用吸管吸起名，一般来说杀霉盘子从相异握部挖频域品，装进杀霉盛样容器。若材料是黏稠，应将边起名边混杂。

液体蔬果

面粉或等易于混匀的蔬果，其成品质可用微小、稳定，可以抽起名小材料（如100g）测定。但散装材料必须从多个点起名大样，且每个材料都要除此以外执行，在测定在此之前要完全混匀，并从中所起名一份材料开展测定。

蔬菜、贝类或近似于的蔬果既要在表皮频域又要在深层频域。深层频域时要小心不用被表面可能会会酸雨，同时可能会会使之暴露在空气当中所。

有些蔬果，如鲜肉或熟肉一般来说消毒的解剖刀和额牛频域；冷冻蔬果可在未解冻的静止状态下一般来说锯子、大石钻或电钻（一般拐角碰到）等获起名深层材料；全蛋粉等黏稠状材料频域时，一般来说消毒的频域器拐角插入箱底，材料分解成频域器后提议箱外，之前用消毒小勺从上、中所、下握部频域。

未收：

· 未收意不用使液体材料主因潮湿，防蔬果中所固有的细霉滋生。

· 蔬果如为非冷藏易腐蔬果，应将不断将所频域品冷却至0℃~4℃；若材料是冷冻的，应将保持冷冻静止状态，汽化寄出。

寄生植常为一般来说霉

寄生植常为一般来说细霉是寄生植常为微生态系统中所的最主要组成之外，并不需要对寄生植常为民间组织样品开展人类基因组计划可用化，可以研究成果寄生植常为一般来说细霉或真霉的自然。

(1) 根据研究成果；也选起名美味寄生植常为民间组织（如果是寄生植常为根部，需要去除根表粘附沙木）；0℃以下带回研究成果所室；

(2) 根据民间组织不等剪去小块或小段（数两道不数0.5cm），在杀霉工作台内，用杀霉水后对寄生植常为民间组织开展洗涤30s；

(3) 表面可能会会杀霉化执行：

第一次冷藏：75%无水后乙醇浸泡1min；第二次冷藏：2%次执行3min，转去75%无水后乙醇浸泡30s，接着用杀霉水后漂洗3次；

(4) 开展核酸提起名研究成果所或液体氮速冻，放徙-80℃冷藏惟有有。气球寄出。

生常为肠道段落常为

(1) 用杀霉握术刀挖起名（或杀霉镊子挤出，也一般来说杀霉生理盐水后灌入出）肠道段落常为；

(2) 并不需要用谷禾频域盒里的亚麻签沾起名平均豆类不等的肠道段落常为，将沾起名段落常为的亚麻签灌入频域管液体蒸隐匿段落常为进到频域管惟有有液体内；蒸平均30-40s，然后派上用场亚麻签，将金属片密封盘上好，短时间下坠频域管数30秒；

(3) 观察到下行液体比如说轻微肠道段落常为颜色即频域得到成功，室温寄出。

人和其它生常为老鼠

(1) 适用在此之前特地浇握脚，防范杂霉冲击。将频域管起名出，盘上开密封。

(2) 用频域亚麻签沾起名少可用美味老鼠(需要要可用为豆类一冬瓜不等)；如老鼠较干，可先将亚麻签在频域泵所浸湿后沾起名；

(3) 将沾起名老鼠的亚麻签灌入频域管液体蒸隐匿老鼠进到频域管惟有有液体内，蒸平均30-40s，然后派上用场亚麻拭子，将金属片密封盘上好，短时间下坠频域管数30秒；

(4) 观察到下行液体比如说轻微老鼠颜色即频域得到成功，室温寄出。

未收：

· 如3月内适用过类固醇类、质子泵类胃药、类精神药常为特地服药3翌日之前测定。

· 感冒、发烧或其他症状之后不因素频域,拉凝或凝之前可以用亚麻签长时间沾起名老鼠至频域管。

· 如长期之前秘无排之前可适用等主要用途握段获起名老鼠样品。

·频域无时间和饮食容许,但是频域在此之前很好情况下饮食。

· 未完成频域后样品可室温有效存储一周,为保障测定行政处分特地未完成频域后决定送回。

舌牛

舌牛拭子

(1) 起名样在此之前30分钟禁食、杜绝酿等；

(2) 正要一杯横山后（平均150ml），将横山后含入牛中所，充份洗漱舌牛平均10秒，减法2-3次。

(3) 将拭子伸入舌牛，使拭子牛充份受伤害左侧舌牛呈圆形，上下牙床处毛细血管，用须要力度上下擦动并回转拭子15-20圈。用比方说分析方法在右侧舌牛呈圆形及上下牙床毛细血管处开展另一根拭子的起名样。

(4) 将拭子徙入频域管惟有有液体内，蒸平均30-40s，然后派上用场拭子，将金属片密封盘上好，短时间下坠频域管数30秒；室温寄出。

舌牛拭子

(1) 起名样在此之前30分钟禁食、杜绝酿等；

(2) 正要一杯横山后（平均150ml），将横山后含入牛中所，充份洗漱舌牛平均10秒，减法2-3次。

(3) 将捕获；也舌牛外拉，使悬雍垂必需要向外牵引。同时，将拭子继续前进舌根到舌牛后壁或者悬雍垂后侧，长时间涂抹15次以上，可能会会受伤害舌、舌牛毛细血管和老鼠体。

(4) 将拭子徙入频域管惟有有液体内，蒸平均30-40s，然后派上用场拭子，将金属片密封盘上好，短时间下坠频域管数30秒；室温寄出。

老鼠体频域

(1) 起名样在此之前30分钟禁食、杜绝酿等；

(2) 正要一杯横山后（平均150ml），将横山后含入牛中所，充份洗漱舌牛平均10秒，减法2-3次。

(3) 用卷舌抵住上颚或下颌齿根以富集老鼠体，向频域泵所轻轻吐入老鼠体，直至液体老鼠体（非气泡）超出2ml 以上。蒸平均30-40s，短时间下坠频域管数30秒；室温寄出。

牙霉斑频域

(1) 起名样在此之前30分钟禁食、杜绝酿等；

(2) 正要一杯横山后（平均150ml），将横山后含入牛中所，充份洗漱舌牛平均10秒，减法2-3次。

(3) 用亚麻卷隔湿所捕获的牙齿，之前以杀霉生理盐水后灌入牙面，用杀霉挖匙或探针捕获窝沟霉斑或唇颊面霉斑；以牙线徙于两邻牙中间，凸贴牙面捕获邻面霉斑。捕获后装进含有惟有有液体的频域下行，蒸平均30-40s，短时间下坠频域管数30秒；室温寄出。

脸部

一、样品筛选

如果病患存在以下可能会，则需要剔除：

(1) 起名样在此之前7天，脸部，牛皮，额牛，胳膊，在此之颈部或者握适用过类固醇或者一般来说液体者；

(2) 脸部，胸部，背部或者肩膀有痤痘者；

(3) 牛皮，脸，额牛，握臂，在此之颈部或者握上有水后泡，脓疱，痘，水肿，泥土或者出血者；

(4) 在频域握部处有临近水后泡，脓疱，痘，水肿，泥土，出血，藓，伤牛，裂纹或者色素及黑色的脸部大修区者；

(5) 身上有有多处深蓝色或红色脸部区域者（暗指或者外阴医护人员）；

(6) 握指或者脚掌脸部增厚或者有裂纹者；

(7) 两周之内，每天适用去屑保健品后都不能明理干净牛皮屑者；

(8) 身体临近或者有多处有散发型红疹者。

二、利用分析方法

(1) 将拭子在杀霉生理盐水后或横山后中所浸湿，在研究成果所最后目标区域涂抹10s；

(2) 样品捕获后尽快将拭子徙入频域管惟有有液体内，蒸平均30-40s，然后派上用场拭子，将金属片密封盘上好，短时间下坠频域管数30秒；室温寄出。

人体内其它握部

民间组织

(1) 起名相应将握部民间组织材料，于杀霉操作台上解剖，用消毒剪刀、解剖刀切起名指甲盖不等近民间组织块；

(2) 将民间组织块装进冻存泵所并盖凸密封，标示好样品个人信息。材料液体氮速冻后装进-80℃冷藏惟有有。气球寄出。

肺泡田间洗液体

(1) 牛舌牛部开展雾化利多卡因后，滴未收120-300mL杀霉生理盐水后开展BAL液体骨骸的利用。频域后离心，去掉上明，起名脱水。

(2) 用液体氮速冻-80℃惟有有，气球寄出；或起名脱水隐匿徙频域管，蒸平均30-40s，短时间下坠频域管数30秒，室温寄出。

肠道田间洗液体

(1) 利用肠道田间洗液体，过膜；或者将肠道田间洗液体离心，弃上明，起名脱水。

(2) 用液体氮速冻-80℃惟有有，气球寄出；或起名脱水隐匿徙频域管，蒸平均30-40s，短时间下坠频域管数30秒，室温寄出。

生殖道

(1) 采用杀霉亚麻拭子，沿着牛、中所部和后穹窿内腔壁回转拭子做圆周运动数次。

(2) 涂抹后尽快将拭子灌入频域泵所的惟有有液体中所，蒸平均30-40s，短时间下坠频域管数30秒，室温寄出。

粪之前液体

(1) 10-20ml（儿童1-3ml）全血利用到真空捕获管（已加入抗凝剂），上下颠倒两次。

(2) 标示个人信息，汽化惟有有，气球寄出。

乳腺

(1) 浇握脚，母乳期用杀霉水后涂抹，起名乳腺5-10ml 3管（除掉第一管）。

(2) 汽化（-20℃）惟有有，气球寄出；或者用拭子沾起名乳腺后，尽快将拭子灌入频域泵所的惟有有液体中所，蒸平均30-40s，短时间下坠频域管数30秒，室温寄出。

冠状动脉后

(1) 利用冠状动脉后10-20ml，离心，弃上明，起名脱水。

(2) 用液体氮速冻-80℃惟有有，气球寄出；或起名脱水隐匿徙我们的频域管，蒸平均30-40s，短时间下坠频域管数30秒，室温寄出。

胃

(1) 胃样品由十二指肠的水法或膀胱穿刺法或握术中所惟有起名胃，捕获胃可用为5ml，徙杀霉下行，离心，弃上明，起名脱水。

(2) 用液体氮速冻-80℃惟有有，气球寄出；或起名脱水隐匿徙我们的频域管，蒸平均30-40s，短时间下坠频域管数30秒，室温寄出。

排泄常为体

(1) 捕获中所段排泄常为体40 ml近。（中所段粪之前：在排粪之前处理过程中所，弃去在此之前、后时段排出的排泄常为体，以杀霉容器利用）；

(2) 一般惟有起名明晨第一次排泄常为体，很好6小时。住院医护人员可以并不需要起名，医护人员将的中所段粪之前利用至杀霉杯中所40 ml为宜；门诊医护人员或表观等无粪之前意者，可以适可用饮水后，在有粪之前意时必需要的多憋一段时间，将排泄常为体的中所段粪之前利用至杀霉粪之前杯中所40 ml为宜；

(3) 离心，去上明，加入我们的液体惟有有，室温寄出。

未收：

· 应将在类固醇适用在此之前或撤除类固醇药5翌日惟有排泄常为体骨骸。

· 对于小之前轻度不等之前医护人员或者时间过长医护人员，对中所段粪之前比较难控制的完全，我们可以转告医护人员在排粪之前处理过程中所3 s后捕获排泄常为体。

·如果是病危或昏迷医护人员，可由相关医务人员用导粪之前分析方法捕获排泄常为体，此操作处理过程中所要申明杀霉操作，可能会会因导粪之前失握而导致的泌粪之前系统感染。也可以采用经腹部在此之前壁膀胱穿刺起名粪之前培训的分析方法。

以上是各类材料的频域分析方法，可供参考。

或许有人问，是否一定要用我们的频域管惟有有液体，能不能用生理盐水后或者别的来替代。下面是我们开展的关于惟有有液体的检测：

经检测，适用谷禾频域管惟有有液体，能在-80℃ ~ 65℃ 的可能会下下保持DNA相容性，室温有效贮存为时30天，必需要保障与美味样品很强一致的霉群组合而成特征。

要想起名得较为理想的人类基因组计划结果，首先材料的质可用需要要起名得保障，当然样品提起名、建库、可用化对最后结果都可能会会产生一定的因素，而频域比方说最主要。如果从未起名好，全面性可用化之前多，可能会也得不到就让的结果。

另外，严谨的研究成果结构设计对于得到确切且有本质的结果也很最主要，研究成果结构设计中所应将未收意考虑混杂因素，如果在不确定的完全，也可以须要咨询我们的技术顾问，结合我们的经验，给您合适的建议。

当然研究成果所处理过程中所，也可能会可能会会受到多种因素的因素，我们可能会会采用HIV和HIV对照，必需要减少这些不必要的因素。

总之，准备在此之前期的正要工作，包括研究成果结构设计，频域等，全面性的提起名、人类基因组计划、可用化交给我们~

的有

[1] Edwards J , Johnson C , Christian Santos-Medellín, et al. Structure, variation, and assembly of the root-associated microbiomes of rice[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2015, 112(8).

[2] Bulgarelli D, Rott M, Schlaeppi K, et al. Revealing structure and assembly cues for Arabidopsis root-inhabiting bacterial microbiota[J]. Nature, 2013, 501(7468): S25.

[3] ISO 10381-6: 2009 Soil quality - Sampling - Part 6: Guidance on the collection, handling and storage of soil under aerobic conditions for the assessment of microbiological processes, biomass and diversity in the laboratory.

[4] Ruiz-González C, Niño-García J P, Kembel S W, et al. Identifying the core seed bank of a complex boreal bacterial metacommunity[J]. The ISME journal, 2017, 11(9): 2012.

[5] Wang Y, Ma L, Mao Y, et al. Comammox in drinking water systems[J]. Water research, 2017, 116: 332-341.

[6] Chow C E T, Winget D M, White III R A, et al. Combining genomic sequencing methods to explore viral diversity and reveal potential virus-host interactions[J]. Frontiers in microbiology, 2015, 6: 265.

[7] Yang Y, Li B, Zou S, et al. Fate of antibiotic resistance genes in sewage treatment plant revealed by metagenomic approach[J]. Water research, 2014, 62: 97-106.

[8] Pesant S, Not F, Picheral M, et al. Open science resources for the discovery and ysis of Tara Oceans data[J]. Scientific data, 2015, 2.

[9] Ma J, Wang Z, Li H, et al. Metagenomes reveal microbial structures, functional potentials, and biofouling-related genes in a membrane bioreactor[J]. Applied microbiology and biotechnology, 2016, 100(11): 5109-5121.

[10] Liu J, Yang H, Zhao M, et al. Spatial distribution patterns of benthic microbial communities along the Pearl Estuary, China[J]. Systematic and applied microbiology, 2014, 37(8): 578-589.

[11] Mason O U, Scott N M, Gonzalez A, et al. Metagenomics reveals sediment microbial community response to Deepwater Horizon oil spill[J]. The ISME journal, 2014, 8(7): 1464.

[12] Bråte J, Logares R, Berney C, et al. Freshwater Perkinsea and marine-freshwater colonizations revealed by pyrosequencing and phylogeny of environmental rDNA[J]. The ISME journal, 2010, 4(9): 1144.

[13] Li J, Sung C Y J, Lee N, et al. Probiotics modulated gut microbiota suppresses hepatocellular carcinoma growth in mice[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2016, 113(9): E1306-E1315.

[14] Gebhart D, Lok S, Clare S, et al. A modified R-type bacteriocin specifically targeting Clostridium difficile prevents colonization of mice without affecting gut microbiota diversity[J]. MBio, 2015, 6(2): e02368-14.

[15] Hänninen A, Toivonen R, Pöysti S, et al. Akkermansia muciniphila induces gut microbiota remodelling and controls islet autoimmunity in NOD mice[J]. Gut, 2018, 67(8): 1445-1453.

[16] Fujisaka S, Avila-Pacheco J, Soto M, et al. Diet, genetics, and the gut microbiome drive dynamic changes in plasma metabolites[J]. Cell reports, 2018, 22(11): 3072-3086.

[17] Agus A, Denizot J, Thévenot J, et al. Western diet induces a shift in microbiota composition enhancing susceptibility to Adherent-Invasive E. coli infection and intestinal inflammation[J]. Scientific reports, 2016, 6: 19032.

[18] Stanley D, Moore R J, Wong C H Y. An insight into intestinal mucosal microbiota disruption after stroke[J]. Scientific reports, 2018, 8(1): 568.

[19] Rabbi M F, Munyaka P M, Eissa N, et al. Human catestatin alters gut microbiota composition in mice[J]. Frontiers in microbiology, 2017, 7: 2151.

[20] Rabbi M F, Eissa N, Munyaka P M, et al. Reactivation of intestinal inflammation is suppressed by catestatin in a murine model of colitis via M1 macrophages and not the gut microbiota[J]. Frontiers in immunology, 2017, 8: 985.

[21] McInnes P, Cutting M. Manual of procedures for human microbiome project: Core microbiome sampling, protocol A, HMP protocol no. 07-001, version 11. 2010[J]. Current version: _MOP_Version12_0_072910.pdf

[22] Jie Z, Xia H, Zhong S L, et al. The gut microbiome in atherosclerotic cardiovascular disease [J]. Nature communications, 2017, 8(1): 845.

[23] Mar J S, LaMere B J, Lin D L, et al. Disease Severity and Immune Activity Relate to Distinct Interkingdom Gut Microbiome States in Ethnically Distinct Ulcerative Colitis Patients [J]. mBio, 2016, 7(4).

[24] Sze M A, Baxter N T, Ruffin M T t, et al. Normalization of the microbiota in patients after treatment for colonic lesions [J]. Microbiome, 2017, 5(1): 150.

[25] Flemer B, Lynch D B, Brown J M, et al. Tumour-associated and non-tumour-associated microbiota in colorectal cancer [J]. Gut, 2017, 66(4): 633-43.